وقتی سید فضل الله در مورد یک سری مسائل مذهبی شیعه شک کرد، این رابطه تا حدی مخدوش شد و حتی پدر ما نامه هایی با ایشان نوشت و به این اشتباهات علمی اشاره کرد که در این مقطع (یعنی سال 92 میلادی) آقای فضل الله پذیرفتند، اما بعداً دوباره ارائه کردند. این موضوعات به شکلی متفاوت در فضای عمومی.
مرتضی عاملی در سال 1395 با نگارش کتاب «الصحیح من سیره امام علی (ع)» جایزه کتاب سال جمهوری اسلامی ایران را در بخش زندگانی معصومین دریافت کرد. یکی از مهم ترین آثار او کتاب «مصیبت الزهرا (سلام الله علیها)» است که درباره حضرت فاطمه (س) است و پس از طرح شبهات و نحوه شهادت آن حضرت تألیف شده است. علاوه بر اینها کتابهای دیگری نیز از وی درباره سیره و تاریخ اهل بیت منتشر شده است.
نظر ایشان در این زمینه به خصوص در بحث تطبیق ها و نشانه ها چیست؟ زیرا عده ای به ویژه برخی از علمای هموطنان بر این باورند که حوادث جاری در کشورهای اسلامی و مسئله ظهور زیاد است.